| 研究中心 | 研究团队 | 研究组 | 博硕导 | 硕导 |
| 植物多样性研究中心 | 植物多样性演化与新质资源利用 |
植物多样性与进化 | 王青锋、严雪、刘帆 | 王生位、 魏能 |
| 东非植物区系与分类 | 胡光万 | 张彩飞 | ||
| 园艺作物逆境生物学 | 辛海平 | |||
| 植物演化与功能基因组学 | 万涛 | |||
| 进化生态学 | 魏娜 | |||
| 植物化学生物学 | 陈桂林 | |||
| 生物多样性保护与生物安全 | 植被生态学 | 魏新增 | 徐耀粘、吴浩 | |
| 系统与进化植物学 | 王恒昌、闫娟 | 孙延霞 | ||
| 入侵生态学 | 黄伟 | 万金龙、张考萍 | ||
| 植物繁殖生态学 | 杨春锋 | 叶忠铭 | ||
| 森林生态学 | 党海山 | 史航 | ||
| 东亚植物演化、保护与创新利用 | 邱英雄 | 马雅真 | ||
| 特色农业资源植物研究中心 | 猕猴桃创新与利用 | 猕猴桃种质资源与育种 | 钟彩虹、张琼 | 李黎、黄文俊 |
| 净果猕猴桃遗传育种 | 王彦昌 | |||
| 猕猴桃群体基因组学 | 姚小洪 | |||
| 被子植物早期演化 | 石涛 | |||
| 猕猴桃遗传改良与种质创新 | 李大卫 | |||
| 特色经济作物改良共性技术创新 | 果树分子育种 | 韩月彭 | 廖燎、郑蓓蓓、张若西 | |
| 草坪草与牧草分子育种 | 陈良 | 张玲玲、谢燕、曹丽雯、 刘芳 | ||
| 园艺植物基因组与分子改良 | 高磊 | 李珊 | ||
| 莲种质资源与遗传育种 | 杨美 | 邓显豹、杨东 | ||
| 果树品质与抗性生物学 | 安建平 | |||
| 本草大健康 | 药用植物资源 | 张燕君 | 黄俊锋 | |
| 植物代谢组学 | 丁俊 | |||
| 药用植物药理学 | 李晶 | 孙宁宁 | ||
| 微藻生物技术 | 丁奕 | 王中杰、温小斌 | ||
| 药用植物抗病毒 | 陈军刚 | 、 | ||
| 水生植物与流域生态研究中心 | 水生植物生态适应与可持续利用 | 水生植物生物学 | 李伟、江红生 | 操瑜、王伟、孙君瑶、韩庆香 |
| 水生植物生物地理学 | 陈进明 | | ||
| 流域水安全 | 系统生态学 | 张全发、谭香、王伟波 | 蒋浩、蒋萌、廖浩 | |
| 湿地生态学 | 刘贵华、马琳 | 吴君君、周雯 | ||
| 水域生态过程学 | 刘文治 | 丁帮璟、苑文珂、卢明珠、何刚 | ||
| 生态系统与可持续发展 | 生态景观工程 | 刘宏涛 | ||
| 全球变化生态学 | 刘峰、 | 田秋香、姜庆虎、赵汝东、方竟 | ||
| 农业环境生态 | 刘毅 | 李志国、陈鹏 | ||
| 元素循环与生态恢复 | 张克荣 | 何铁虎 | ||
| 水陆交错带生态学 | 叶琛 | 龚宇 |
